Parler de royaume, on en voit déjà les frontières. Le royaume du Burundi faisait face à des tentatives d’invasions d’origines diverses, d’où la croyance que la défense remonte des temps très anciens.
Le roi du Burundi Mwezi Gisabo a résisté à la colonisation allemande grâce à la bravoure des Abahevyi et des Abadasigana. La capitulation de Kiganda en 1903 aurait fragilisé la défense proprement burundaise. Sa sécurité aurait été assurée par les colons allemands et belges. La création de la Garde Territoriale en 1960 était considérée comme l’embryon de l’Armée Nationale. C'est à partir de cette année que les premiers recrutements ont commencé sous la Tutelle belge.
Durant la période coloniale, la force en charge de l’ordre et de la sécurité publique au Burundi était constituée essentiellement d’agents congolais sous la supervision de sous-officiers et d’officiers belges. Au lendemain de l’indépendance du Congo en 1960, des troupes belges furent envoyées précipitamment au Burundi pour pallier le départ précipité des unités congolaises de la force publique et 175 soldats furent recrutés et formés à la hâte la même année par la Belgique.
En 1962, l’indépendance signifiait la reconnaissance d’un Burundi capable d’assurer sa souveraineté. La sécurité du Burundi fut confiée à deux unités : la sécurité intérieure revient à la Gendarmerie tandis que l’armée nationale s’occupe de la sécurité des frontières. Dans ce contexte, le renforcement de la capacité militaire ne pouvait pas attendre.
Voici l’évolution : le 01 juillet 1962, il y eut création du Secrétariat d’Etat à la Défense avec Zénon Nicayenzi comme secrétaire d’Etat à la Défense. De 1966 au 31 Décembre 2004, l’armée burundaise s’appelait « Forces Armées Burundaises (FAB) ». Depuis le 31 décembre 2004, avec l’intégration des ex-mouvements armés, l’Armée Burundaise s’appelle Force de Défense Nationale du Burundi « FDNB ».
Le premier Chef d’Etat-major de l’armée burundaise était un belge dénommé Verwhein.
Voici la liste des Secrétaires d’Etat et des Ministres de la Défense Nationale du Burundi :
- Nicayenzi Zénon : 1962-1963
- Lt-Gén Micombero Michel : 1963-1976
- Col Bagaza Jean Baptiste : 1976-1987
- Maj Buyoya Pierre : 1987-1988
- Col Maregarege Léonidas : 1988-1993
- Col Ntakije Charles : 1993-1994
- Col Fyiroko Gédéon : 1994-1994
- Col Sinzoyiheba Firmin : 1994-1997
- Col Nkurunziza Alfred : 1997-2000
- Gén-maj Ndayirukiye Cyrille : 2000-2002
- Lt-Gén Niyungeko Vincent : 2002-2005
- Lt-Gén Niyoyankana Germain : 2005-2010
- Gén-maj Gaciyubwenge Pontien : 2010-2015
- Ntawomvukiye Emmanuel : 2015-2020
- Ir Alain Tribert Mutabazi : 2020-
Après la fusion entre les ex Partis et Mouvements Politiques Armées (PMPA)et les ex Forces Armées (FAB), la Force de Défense Nationale du Burundi est souvent citée comme modèle.